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淺談影響熒光定量PCR實驗結果的幾大因素
首先什么是PCR呢?
PCR的全稱是聚合酶鏈式反應(英文全稱:Polymerase Chain Reaction),是一種體外酶促合成特異DN的方法,也可以稱作無細胞分子克隆或DNA序列體外引物定向酶促擴增技術。它不僅可用于基因分離,克隆和核酸序列分析等基礎研究,還可用于疾病的診斷或任何有DNA,RNA的地方。
PCR分為定性PCR和定量PCR兩類:定性PCR只能通過終點法對擴增產物進行定性分析,而不能進行定量分析;定量PCR能通過加入的熒光分子信號的變化來實現對PCR產物的實時檢測。相對來說,定量PCR的檢測靈敏度更高;特異性好,準確性高;線性關系好,范圍寬;操作更簡單安全。
PCR實驗的基本因素及過程反應成分:引物,酶,模板DNA,dNTP,Mg2+鎂離子濃度 。
反應過程:1、模板變性;2、引物退火;3、新鏈延伸。
這三個步驟為一個循環(huán),每一個循環(huán)度產物均可作為下一個循環(huán)度模板,經過n次循環(huán)后,目的DNA以2n的形式增加。
除了以上五個主要因素外,還有實驗耗材因素和溫度因素:
1:首先PCR實驗試劑的總體積一般為25ul~100ul,因此所選用的耗材必須是吸附低的;
2:PCR實驗需要高溫解鏈,低溫合鏈,中溫延伸,因此要求所選用的耗材需要有很好的熱傳導率;
3:PCR實驗需要不斷的循環(huán)升溫,降溫,這就要求所選用的耗材必須有良好的氣密性;
4:PCR實驗還需要循壞的收集數據,需要選用的耗材有良好的均一性。
5:另外根據實驗使用儀器的不同,熒光定量實驗中熒光讀取方式不同,對耗材還有以下不同的要求:
a:采用頂部熒光照射并于頂部回收熒光的儀器,要求管蓋或者封板膜必須是光學透光的性能,同時管壁最好選擇不透光材質;
b:采用側方熒光照射并于頂部回收熒光的儀器,要求管蓋或者封板膜必須是光學透光性,同時管壁也要是高透光的透明材質;
c:采用側方熒光照射并于側方回收熒光的儀器,要求管蓋或者封板膜最好選用不透光材質,同時管壁選擇高透光的透明材質。
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